基于英特尔®架构的高性能计算(HPC)集群大显神通助力亚太地区生命科学研究
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基于英特尔®架构的高性能计算(HPC)集群大显神通助力亚太地区生命科学研究  2012/3/1
全球最大的芯片制造商,同时也是计算机、网络和通讯产品的领先制造商英特尔公司今天宣布,基于英特尔®架构的高性能计算(HPC)集群和服务器目前正在为亚太地区数十个新的生命科学和生物IT计划提供强大动力。正在亚洲新兴生命科学产业准备在今后5年大展宏图之时,全球也正出现向经济高效工业标准技术平台的转变,能够加速生物IT技术发展的新型HPC超级计算机将登上舞台。因需要最大限度压缩IT预算,亚洲数十个学术和科研机构不约而同
  全球最大的芯片制造商,同时也是计算机、网络和通讯产品的领先制造商英特尔公司今天宣布,基于英特尔®架构的高性能计算(HPC)集群和服务器目前正在为亚太地区数十个新的生命科学和生物IT计划提供强大动力。正在亚洲新兴生命科学产业准备在今后5年大展宏图之时,全球也正出现向经济高效工业标准技术平台的转变,能够加速生物IT技术发展的新型HPC超级计算机将登上舞台。

因需要最大限度压缩IT预算,亚洲数十个学术和科研机构不约而同地选择了建立基于英特尔®架构的HPC集群或服务器,以便充分利用其高性价比的领先优势。最近实施部署的15个机构分别是墨尔本大学、昆士兰州并行超级计算机基金会(澳大利亚)、香港浸会大学、香港大学生物信息和应用生物技术学院、印度科学院超级计算教育研究中心、印度技术研究所、印度科学与工业研究中心、清华大学生物信息研究所、新加坡基因研究所、新加坡南洋理工大学、新加坡生物信息学院、国立新加坡大学超级计算与可视化科学系、以及新加坡MIT联合学校 、TW高雄市ZF生物信息网格网络。

清华大学在其信息科学与技术学院内成立了生物信息研究所。这是一所跨学科的研究所,人员和设施均来自该校生物系、技术科学系和自动化系。生物信息研究所的宗旨是使用基于最新英特尔至强处理器的集群系统从事尖端的生物信息研究,探索基因组排序/功能基因组表达等重大课题。清华大学高性能计算中心(参与了生物信息研究工作)主任, 计算机系教授郑纬民介绍说:“清华大学基于144路英特尔至强处理器的集群系统为我们提供了高性能和经济高效的解决方案,满足了生物信息研究的苛刻计算要求。借助英特尔软件工具和编译器,我们能够在英特尔架构集群系统上最大限度地发挥基因组排序算法的性能。”

IDC估计,公共和私人投资者将向该地区的生命科学市场投入500亿美元;到2006年,亚太地区的生物IT收入将达到26亿美元,复合年增长率高达46%。IDC亚太地区生命科学总监评价道:“我们看到目前亚洲存在两大趋势。首先,生命科学机构将高达50%的资本支出投入支持计划所必需的‘技术积累’,他们一直需要更强大的计算能力来加速新的发现。其次,我们看到由于这个方兴未艾的行业尝试从其‘资本支出’投资中获得最大回报,他们对于经济高效、工业标准的HPC平台产生越来越浓厚的兴趣。

英特尔亚太区解决方案事业部地区总监Jason Fedder先生今天在2003年BioITWorld香港年会上发表主题演讲时称:“生命科学行业对HPC强大计算能力不断增长的需求将成为未来10年计算创新的主要推动力量。我们期待使用基于英特尔®安腾®2、英特尔®至强™和英特尔®奔腾®4处理器的开放标准构建模块的英特尔架构集群和网格网络能够提供企业所需要的性能和经济性。”

2002年11月,英特尔曾经宣布正在将重点转向生命科学领域。Fedder先生同时介绍了英特尔如何提供集成HPC解决方案,包括平台架构、互连和网络构建模块、软件工具和库以及服务。

英特尔架构技术推动亚洲生命科学研究

最近至少有15个亚洲领先科研机构已经选择了英特尔架构HPC集群或服务器,并已经投入运行或计划投入运行,以帮助推进生命科学计划。这些机构参与了各种计划,从基因组排序、蛋白质合成和功能性基因学到中药项目。

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